7月11日,我校信息科学与技术学院吉国力教授课题组与美国迈阿密大学李庆顺教授(我校信息科学与技术学院客座教授)等多校实验室合作,在国际权威期刊《美国科学院院刊》(PNAS,2010年影响因子9.771)上发表题为“Genome-wide landscape of polyadenylation in Arabidopsis provides evidence for extensive alternative polyadenylation”的研究论文。
该研究得到了国家自然科学基金委、教育部、厦门大学、美国国家基金委等多项基金的支持,论文第一作者是信息科学与技术学院博士生吴小惠同学。
APA(Alternative Polyadenylation, 选择性多聚腺苷化)是mRNA选择性加工的重要环节,对发育、代谢及疾病有重要影响。该论文应用生物信息学方法分析了poly(A)定位的深度测序技术产生的拟南芥的海量序列,将模型算法分析与生物实验结合,发现了APA的广泛网络,同时确证了拟南芥反向转录本的广泛存在性,揭示了APA在基因表达中的作用远超过预期。从全基因组水平研究了APA相关机制。该成果有利于加深对植物转录组编码的真实范围理解,对于植物基因组注释、内含子可变剪接、新基因预测、基因表达调控研究有重要生物学与信息学意义。